Նա ունի ավելին քան 20 տարվա աշխատաքային փորձ կառավարման, միջազգային համակարգերի ներդրման ոլորտում:
Ղեկավարում է 3 կառույց՝ «Սիգնում» խորհրդատվական ընկերության, Որակի կառավարման ակադեմիայի հիմնադիր տնօրենն է, համաշխարհային ազատ տնտեսական գոտիների կազմակերպության Եվրոպայի և ԱՊՀ տարածաշրջանային տնօրենն է:
Մի շարք հոդվածների հեղինակ Նիկա Մանուկովան նաև իր փորձով կիսվում է երիտասարդների հետ` դասավանդելով «Եվրասիա» միջազգային համալսարանում: